淺談細胞STR鑒定的意義
點擊量:發(fā)布時間:2019-12-01 15:14:25文章來源:未知
一、 STR檢測介紹
STR是短串聯(lián)重復(fù)序列,也叫微衛(wèi)星序列。是由2-6個堿基n次重復(fù)形成的具有高度多態(tài)性的序列。廣泛應(yīng)用于法醫(yī)領(lǐng)域的身份識別和親權(quán)鑒定、遺傳病的輔助診斷。
ICLAC(國際細胞鑒定委員會)于2012年成立,推薦STR檢測用于人源細胞系的身份鑒定,并制定了相應(yīng)的標準: Standardization of STR Pro?ling (ASN-0002-2011)。該委員會的成立,目的就是推動醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域?qū)?strong>細胞系的錯誤識別和交叉污染問題的深刻認識,并將細胞系的身份認證作為有效的方法來減少和防止細胞系的錯誤識別,交叉污染。
二、 細胞STR檢測身份認證的背景
2.1 ICLAC統(tǒng)計并發(fā)布了截止2018.10.14日細胞錯誤識別的信息目錄,共計529株細胞,其中486株細胞,已無法找到真實的原始樣本;43株細胞原先被發(fā)現(xiàn)是錯誤識別的,現(xiàn)已經(jīng)找到了原始的真實樣本;60株細胞與原供體不一致,但污染物未知;54株細胞種屬來源不一致;有149個污染物,最常見的是Hela,其次是T-24,M14。
(ICLAC已公布的細胞污染列表可聯(lián)系[email protected]索取)
2.2 關(guān)于細胞系錯誤認證的參考文獻
三、細胞STR鑒定的意義
3.1 為科研界的細胞驗明正身,避免因"張冠李戴”而不自知造成的損失。
在所有醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,對于細胞系的使用是在普遍不過的。然而由于細胞系的質(zhì)控在發(fā)展的過程中,并沒有一開始得到重視。只是在往后的科學(xué)研究中,不斷發(fā)現(xiàn)用同樣的細胞系,做同樣的實驗,結(jié)果無法重現(xiàn)或者結(jié)果千差萬別。細胞形態(tài)明明與胃來源相似,經(jīng)鑒定確是肝細胞系。甚至發(fā)現(xiàn)明明是人的細胞,經(jīng)鑒定卻變成了小鼠或者大鼠細胞。如此這樣的“張冠李戴”現(xiàn)象,在全世界不同實驗室不斷上演。
所幸國際細胞鑒定委員會(ICLAC)這樣一個組織的成立,將為科研界使用的細胞系,帶來驗明真身的機會。我們可以看到國際上各大細胞庫(包括ATCC,DSMZ,JCRB,ECACC,KCLB,CBA,COG等)已經(jīng)對庫里的細胞進行了一個叫做STR鑒定的工作,為存儲的細胞獲取了身份標簽。并以此為依據(jù),對這些細胞系的子代細胞進行溯源身份質(zhì)控和交叉污染監(jiān)控。于此同時,Scinece,Nature,cell等國際權(quán)威雜志及其子刊也呼吁并要求
欲發(fā)表的論文,需要對研究所涉及的細胞進行鑒定,以確保所用細胞沒有問題。
3.2 使用正確的細胞系,讓科研結(jié)果更真實,也讓同行能夠有機會互相驗證結(jié)果。
3.3 為胞的身份溯源,找到了原始的依據(jù)(細胞的STR數(shù)據(jù))。
然而即便如此,細胞的真實身份的鑒定問題,仍然面臨不小的挑戰(zhàn)。這需要科研界和相關(guān)領(lǐng)域同仁共同的努力。只有提高認識,并嚴肅認真對待。方能還我們使用的細胞一個公道。
STR是短串聯(lián)重復(fù)序列,也叫微衛(wèi)星序列。是由2-6個堿基n次重復(fù)形成的具有高度多態(tài)性的序列。廣泛應(yīng)用于法醫(yī)領(lǐng)域的身份識別和親權(quán)鑒定、遺傳病的輔助診斷。
ICLAC(國際細胞鑒定委員會)于2012年成立,推薦STR檢測用于人源細胞系的身份鑒定,并制定了相應(yīng)的標準: Standardization of STR Pro?ling (ASN-0002-2011)。該委員會的成立,目的就是推動醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域?qū)?strong>細胞系的錯誤識別和交叉污染問題的深刻認識,并將細胞系的身份認證作為有效的方法來減少和防止細胞系的錯誤識別,交叉污染。
二、 細胞STR檢測身份認證的背景
2.1 ICLAC統(tǒng)計并發(fā)布了截止2018.10.14日細胞錯誤識別的信息目錄,共計529株細胞,其中486株細胞,已無法找到真實的原始樣本;43株細胞原先被發(fā)現(xiàn)是錯誤識別的,現(xiàn)已經(jīng)找到了原始的真實樣本;60株細胞與原供體不一致,但污染物未知;54株細胞種屬來源不一致;有149個污染物,最常見的是Hela,其次是T-24,M14。
(ICLAC已公布的細胞污染列表可聯(lián)系[email protected]索取)
2.2 關(guān)于細胞系錯誤認證的參考文獻
| 文章名稱 | 發(fā)表雜志及時間 |
| Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines | Nature 492: 186,2012 |
| Cell line misidentification: the beginning of the end | Nat Rev Cancer. 2010 Jun |
| Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines |
Int J Cancer, 21 April 2010 |
| False and mycoplasma contaminated leukemia-lymphoma cell lines: time for a reappraisal |
Int J Cancer, 2017 |
| Reproducibility: changing the policies and culture of cell line authentication |
Nature Methods ,2015.5.28 |
| The ghosts of HeLa: How cell line misidentification contaminates the scientific literature |
PLoS One. 2017 Oct 12 |
| DNA profiling analysis of endometrial and ovarian cell lines reveals misidentification, redundancy and contamination |
Gynecol Oncol. 2012 Oct |
| Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines |
Methods Mol Biol. 2013 |
三、細胞STR鑒定的意義
3.1 為科研界的細胞驗明正身,避免因"張冠李戴”而不自知造成的損失。
在所有醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,對于細胞系的使用是在普遍不過的。然而由于細胞系的質(zhì)控在發(fā)展的過程中,并沒有一開始得到重視。只是在往后的科學(xué)研究中,不斷發(fā)現(xiàn)用同樣的細胞系,做同樣的實驗,結(jié)果無法重現(xiàn)或者結(jié)果千差萬別。細胞形態(tài)明明與胃來源相似,經(jīng)鑒定確是肝細胞系。甚至發(fā)現(xiàn)明明是人的細胞,經(jīng)鑒定卻變成了小鼠或者大鼠細胞。如此這樣的“張冠李戴”現(xiàn)象,在全世界不同實驗室不斷上演。
所幸國際細胞鑒定委員會(ICLAC)這樣一個組織的成立,將為科研界使用的細胞系,帶來驗明真身的機會。我們可以看到國際上各大細胞庫(包括ATCC,DSMZ,JCRB,ECACC,KCLB,CBA,COG等)已經(jīng)對庫里的細胞進行了一個叫做STR鑒定的工作,為存儲的細胞獲取了身份標簽。并以此為依據(jù),對這些細胞系的子代細胞進行溯源身份質(zhì)控和交叉污染監(jiān)控。于此同時,Scinece,Nature,cell等國際權(quán)威雜志及其子刊也呼吁并要求
欲發(fā)表的論文,需要對研究所涉及的細胞進行鑒定,以確保所用細胞沒有問題。
3.2 使用正確的細胞系,讓科研結(jié)果更真實,也讓同行能夠有機會互相驗證結(jié)果。
3.3 為胞的身份溯源,找到了原始的依據(jù)(細胞的STR數(shù)據(jù))。
然而即便如此,細胞的真實身份的鑒定問題,仍然面臨不小的挑戰(zhàn)。這需要科研界和相關(guān)領(lǐng)域同仁共同的努力。只有提高認識,并嚴肅認真對待。方能還我們使用的細胞一個公道。
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